許多業者都面臨了選擇B2B或B2C商業模式的難題，也有不少企業正是因為選擇了不適當的模式與平台，使跨境電商發展失敗。正確選擇B2B或B2C商業模式與企業擁有的資源、核心能力、服務內容、產品屬性以及市場競爭等條件有關。商業模式最直接的影響就是跨境平台的選擇，例如B2B平台以阿里巴巴國際站為代表，亞馬遜也推出了Amazon Business的B2B銷售，而B2C平台則以亞馬遜,eBay,Aliexpress為主，兩種平台的運營概念有很大的不同。

B2B模式的買家為了商業用途而採購，他們會將大宗採購的產品再加工後出售，或是直接再轉售給下游的買家，因為在商言商，通常購買過程較為理性，購買的單數少，每次購買的產品數量多，金額較高。由於B2B買家也是專業人員，他們對於產品本身的了解，以及進口程序、法規與運送等細節熟悉，賣方通常只要將產品依照指定的方式運送給買方，交易就算完成，後續不會有大量的客戶服務如物流或產品使用的問題。

相對的，B2C模式的購買者為了自用而購買，每次購買的數量少，金額較低，且他們不是專業的人員，對於產品本身以及產品進口與運送的程序並不熟悉，因此B2C賣家將會面對全世界眾多的訂單，需要一一地進行服務，將產品按照各國的條件，送到每個客人的手上，例如產品被海關查扣，必須繳稅或是產品使用方法不清楚等疑難雜症。且目前不少國家對於產品跨境購買制定了關稅與營業稅的法規，B2C賣家必須合法的在某些國家設定納稅的單位，才能進行銷售。因此，B2C模式將會需要大量的服務人力以協助複雜的各國零售事務。【加入會員看完整文章與圖片】